《山西农业科学》

《山西农业科学》2020年 第2期 | 张贺平   中化化肥有限公司河北分公司 河北石家庄050031

摘　要：为研究不同毒力小麦条锈菌侵染过程中基因表达差异,通过RNA-seq测定其转录组并分析差异表达基因。结果表明,每个小麦条锈菌转录组文库产生8000万~9000万条读长,其中,至少71.15%的读长可以比对到参考基因组。将读长转换计算出FPKM值并比较多个基因表达水平,FPKM值小于15的基因数分别占对应文库的79.17%、79.24%、80.01%和79.41%,FPKM值大于60的基因数所占比例均低于7.0%,而FPKM值大于10000的基因在CY31、CY32、CY33和V26菌系样品文库中分别有7、8、7、7个。从|log2Fold change|≥1且FDR<0.005这2个水平评估小麦条锈菌CY31、CY32、CY33和V26菌系间差异表达基因,结果显示,差异水平变化主要集中在6倍以内,差异倍数最大的一个基因为13倍。将差异表达基因与KEGG数据库比对发现,共有53个基因被注释到了KEGG中的36个通路中,其中,显著富集通路(P<0.05)有5个,主要参与到氧化磷酸化、淀粉和糖代谢等通路中。可见,小麦条锈菌CY31、CY32、CY33和V26菌系间产孢时在糖类的代谢、磷酸化等方面变化明显,说明小麦条锈菌产孢可能受糖代谢系统的调节。
【分　类】 【农业科学】 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 禾谷类作物病虫害 > 麦类病虫害 > 病害 > 侵（传）染性病害 > 条锈病
【关键词】 小麦条锈菌 转录组 差异表达基因 遗传多样性
【出　处】 《山西农业科学》2020年 第2期 131-135页　共5页
【收　录】 中文科技期刊数据库